MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caulobacter crescentus NA1000 chromosome

Total Repeats: 103591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011916	GCG	2	6	89	94	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011916	GAT	2	6	105	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011916	GCG	2	6	138	143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011916	ACG	2	6	151	156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011916	GAT	2	6	223	228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221232940
6	NC_011916	GCC	2	6	267	272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232940
7	NC_011916	GCGG	2	8	342	349	0 %	0 %	75 %	25 %	221232940
8	NC_011916	GC	3	6	353	358	0 %	0 %	50 %	50 %	221232940
9	NC_011916	CG	3	6	424	429	0 %	0 %	50 %	50 %	221232940
10	NC_011916	GTG	2	6	457	462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221232940
11	NC_011916	CGC	2	6	537	542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232940
12	NC_011916	GC	3	6	581	586	0 %	0 %	50 %	50 %	221232940
13	NC_011916	TGG	2	6	719	724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221232940
14	NC_011916	ATCT	2	8	757	764	25 %	50 %	0 %	25 %	221232940
15	NC_011916	GC	3	6	780	785	0 %	0 %	50 %	50 %	221232940
16	NC_011916	GCC	2	6	809	814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232940
17	NC_011916	CGC	2	6	815	820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232940
18	NC_011916	GAA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221232940
19	NC_011916	TCG	2	6	854	859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232940
20	NC_011916	CCG	2	6	894	899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232940
21	NC_011916	CT	4	8	910	917	0 %	50 %	0 %	50 %	221232940
22	NC_011916	CGACGC	2	12	945	956	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221232940
23	NC_011916	ATC	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221232940
24	NC_011916	GC	3	6	979	984	0 %	0 %	50 %	50 %	221232940
25	NC_011916	GAG	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221232940
26	NC_011916	CGG	4	12	1046	1057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232940
27	NC_011916	CTG	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232940
28	NC_011916	GGA	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221232940
29	NC_011916	GAT	2	6	1151	1156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221232941
30	NC_011916	GAA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221232941
31	NC_011916	CGC	2	6	1211	1216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232941
32	NC_011916	CGC	2	6	1246	1251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232941
33	NC_011916	CGGCC	2	10	1305	1314	0 %	0 %	40 %	60 %	221232941
34	NC_011916	GCCCGC	2	12	1386	1397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232941
35	NC_011916	CGG	2	6	1435	1440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232941
36	NC_011916	CGGC	2	8	1457	1464	0 %	0 %	50 %	50 %	221232941
37	NC_011916	TCG	2	6	1477	1482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232941
38	NC_011916	TA	3	6	1533	1538	50 %	50 %	0 %	0 %	221232941
39	NC_011916	GGTC	2	8	1564	1571	0 %	25 %	50 %	25 %	221232941
40	NC_011916	GCCT	2	8	1645	1652	0 %	25 %	25 %	50 %	221232941
41	NC_011916	GCT	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232941
42	NC_011916	CGG	2	6	1732	1737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232942
43	NC_011916	CGGC	2	8	1800	1807	0 %	0 %	50 %	50 %	221232942
44	NC_011916	CGG	2	6	1836	1841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232942
45	NC_011916	GGC	2	6	1877	1882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232942
46	NC_011916	GGC	2	6	1972	1977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232942
47	NC_011916	CTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232942
48	NC_011916	CTG	3	9	2141	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232942
49	NC_011916	GC	3	6	2154	2159	0 %	0 %	50 %	50 %	221232942
50	NC_011916	GTC	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232942
51	NC_011916	CG	4	8	2188	2195	0 %	0 %	50 %	50 %	221232942
52	NC_011916	CTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232942
53	NC_011916	ATC	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221232942
54	NC_011916	GCG	3	9	2310	2318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232942
55	NC_011916	TGACCC	2	12	2337	2348	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221232942
56	NC_011916	CCG	2	6	2355	2360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232942
57	NC_011916	GCC	2	6	2417	2422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232942
58	NC_011916	TGC	3	9	2451	2459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232942
59	NC_011916	CGA	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221232943
60	NC_011916	CT	3	6	2668	2673	0 %	50 %	0 %	50 %	221232943
61	NC_011916	GCG	2	6	2688	2693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232943
62	NC_011916	CGT	2	6	2723	2728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232943
63	NC_011916	TTC	2	6	2844	2849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221232943
64	NC_011916	GCT	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232943
65	NC_011916	GGT	4	12	2936	2947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221232943
66	NC_011916	CCG	2	6	2956	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232943
67	NC_011916	GCCC	2	8	2985	2992	0 %	0 %	25 %	75 %	221232943
68	NC_011916	GC	3	6	3053	3058	0 %	0 %	50 %	50 %	221232943
69	NC_011916	CG	3	6	3101	3106	0 %	0 %	50 %	50 %	221232943
70	NC_011916	CCGC	2	8	3142	3149	0 %	0 %	25 %	75 %	221232943
71	NC_011916	ATC	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221232944
72	NC_011916	ACC	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221232944
73	NC_011916	CCG	2	6	3341	3346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232944
74	NC_011916	CGT	2	6	3444	3449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232944
75	NC_011916	CGC	2	6	3462	3467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232944
76	NC_011916	GAG	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221232944
77	NC_011916	TGGCCA	2	12	3548	3559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221232944
78	NC_011916	CTCG	2	8	3585	3592	0 %	25 %	25 %	50 %	221232944
79	NC_011916	CTG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232944
80	NC_011916	GGC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232944
81	NC_011916	CGC	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232944
82	NC_011916	CGC	2	6	3911	3916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011916	CGA	2	6	3924	3929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011916	CT	3	6	3985	3990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011916	TCG	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232945
86	NC_011916	GC	3	6	4062	4067	0 %	0 %	50 %	50 %	221232945
87	NC_011916	CTG	2	6	4127	4132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232945
88	NC_011916	GGC	3	9	4153	4161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232945
89	NC_011916	CGA	2	6	4168	4173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221232945
90	NC_011916	CGC	2	6	4216	4221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232945
91	NC_011916	CGG	2	6	4287	4292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232945
92	NC_011916	ATC	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221232945
93	NC_011916	GCC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232945
94	NC_011916	GCG	2	6	4356	4361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232945
95	NC_011916	GAT	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221232945
96	NC_011916	GCC	2	6	4397	4402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232945
97	NC_011916	CGG	2	6	4456	4461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232945
98	NC_011916	CCGG	2	8	4518	4525	0 %	0 %	50 %	50 %	221232945
99	NC_011916	ATG	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221232945
100	NC_011916	GGA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221232945
101	NC_011916	CCG	2	6	4578	4583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232945
102	NC_011916	CGA	2	6	4594	4599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221232945
103	NC_011916	CGC	2	6	4612	4617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232945
104	NC_011916	CGC	2	6	4635	4640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232945
105	NC_011916	GCC	2	6	4673	4678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232945
106	NC_011916	GAC	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221232945
107	NC_011916	GAC	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221232945
108	NC_011916	GAAG	2	8	4753	4760	50 %	0 %	50 %	0 %	221232945
109	NC_011916	TCG	2	6	4773	4778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232945
110	NC_011916	CCTG	2	8	4851	4858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011916	CAGC	2	8	4873	4880	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011916	CG	3	6	4895	4900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011916	GCC	2	6	4924	4929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011916	CG	3	6	4930	4935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011916	AAT	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221232946
116	NC_011916	AAG	2	6	4981	4986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221232946
117	NC_011916	CGCC	2	8	5001	5008	0 %	0 %	25 %	75 %	221232946
118	NC_011916	CGC	2	6	5029	5034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232946
119	NC_011916	CG	3	6	5036	5041	0 %	0 %	50 %	50 %	221232946
120	NC_011916	GTCGCC	2	12	5089	5100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221232946
121	NC_011916	GGC	2	6	5103	5108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232946
122	NC_011916	GC	3	6	5136	5141	0 %	0 %	50 %	50 %	221232946
123	NC_011916	GCC	2	6	5197	5202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232946
124	NC_011916	GAA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221232946
125	NC_011916	AGT	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011916	GGC	3	9	5512	5520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011916	TG	3	6	5550	5555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011916	CG	3	6	5572	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011916	G	6	6	5582	5587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011916	CGG	2	6	5588	5593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011916	GCG	2	6	5603	5608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011916	GCCA	2	8	5657	5664	25 %	0 %	25 %	50 %	221232947
133	NC_011916	CGG	2	6	5673	5678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232947
134	NC_011916	CGG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232947
135	NC_011916	CGCC	2	8	5778	5785	0 %	0 %	25 %	75 %	221232947
136	NC_011916	TGC	2	6	5787	5792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232947
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138	NC_011916	GTC	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232947
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268	NC_011916	CGC	2	6	11420	11425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_011916	CACGC	2	10	11476	11485	20 %	0 %	20 %	60 %	221232951
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272	NC_011916	TTC	2	6	11608	11613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221232951
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342	NC_011916	CGCC	2	8	14057	14064	0 %	0 %	25 %	75 %	221232951
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380	NC_011916	GCG	2	6	15838	15843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232952
381	NC_011916	GC	4	8	15865	15872	0 %	0 %	50 %	50 %	221232952
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384	NC_011916	ACC	2	6	15946	15951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221232952
385	NC_011916	TGA	2	6	15955	15960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221232952
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391	NC_011916	CGC	3	9	16178	16186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232952
392	NC_011916	CCA	2	6	16199	16204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221232952
393	NC_011916	CG	3	6	16223	16228	0 %	0 %	50 %	50 %	221232952
394	NC_011916	GGC	2	6	16229	16234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232952
395	NC_011916	GCT	2	6	16235	16240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232952
396	NC_011916	CGC	2	6	16253	16258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232952
397	NC_011916	GGC	2	6	16271	16276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232952
398	NC_011916	CGT	2	6	16341	16346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232952
399	NC_011916	GCG	2	6	16347	16352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232952
400	NC_011916	GCC	3	9	16365	16373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232952
401	NC_011916	CGC	2	6	16400	16405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232952
402	NC_011916	GGT	2	6	16409	16414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221232952
403	NC_011916	CGC	2	6	16418	16423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232952
404	NC_011916	TCG	2	6	16430	16435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232952
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410	NC_011916	GCC	2	6	16594	16599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232952
411	NC_011916	CGC	2	6	16676	16681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232952
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429	NC_011916	GGC	2	6	17297	17302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232953
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442	NC_011916	CCGA	2	8	17672	17679	25 %	0 %	25 %	50 %	221232954
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462	NC_011916	GGC	2	6	18531	18536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221232956
463	NC_011916	GCC	2	6	18544	18549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232956
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465	NC_011916	GCC	2	6	18661	18666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221232956
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471	NC_011916	CGCA	2	8	18876	18883	25 %	0 %	25 %	50 %	221232957
472	NC_011916	CGT	2	6	18893	18898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232957
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484	NC_011916	G	6	6	19736	19741	0 %	0 %	100 %	0 %	221232957
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498	NC_011916	TCG	2	6	20224	20229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221232958
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500	NC_011916	GC	3	6	20272	20277	0 %	0 %	50 %	50 %	221232958

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